绘制神经募集曲线 (Neural recruiment curve)

绘制神经募集曲线 (Neural recruiment curve)

1.建立模块化函式架构

 

 

先将每一个动作(加载模型、产生轴突、建立模拟…)都定义成函式

 

2.加载模型

 

 

模型须为 .sab 格式,内含神经与电极几何体

模型档案可于 Sim4Life Tutorial 文件夹下的 CAD files 中找到,分别为 DBS 与 nerve_model_electrode。 请于下方的 loadModel 函式中修改对应的档案路径

 

 



 

3.建立轴突分布

 

 

对每个 fascicle 撷取横切面

 

产生多条 spline 轴突路径

4.建立电磁模拟

 

 

建立一个低频静态场仿真(Electro Ohmic QS)

 

5.将轴突转为神经模型

 

 

 

 

6.建立与执行神经模拟

 

 

会建立 NEURON 模拟,使用 titration 找出每条神经的最小激发电流(threshold)

 

7.分析神经模拟

 

 

取出每条神经的 Titration Factor

 

8.分析与绘制Recruitment Curve

 

 

建立 log-spaced 电流序列 

计算每个电流下的被激发比例(%)

绘制出 Recruitment Curve

 

9.分析与绘制Selectivity Curve

 

 

会针对每个电流点模拟一次,取出每个 fascicle 的 Selectivity Index

 

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