繪製神經募集曲線 (Neural recruiment curve)

繪製神經募集曲線 (Neural recruiment curve)

1.建立模組化函式架構

 

 

先將每一個動作(載入模型、產生軸突、建立模擬…)都定義成函式

 

2.載入模型

 

 

模型須為 .sab 格式,內含神經與電極幾何體

模型檔案可於 Sim4Life Tutorial 資料夾下的 CAD files 中找到,分別為 DBS 與 nerve_model_electrode。 請於下方的 loadModel 函式中修改對應的檔案路徑

 

 



 

3.建立軸突分布

 

 

對每個 fascicle 擷取橫切面

 

產生多條 spline 軸突路徑

4.建立電磁模擬

 

 

建立一個低頻靜態場模擬(Electro Ohmic QS)

 

5.將軸突轉為神經模型

 

 

 

 

6.建立與執行神經模擬

 

 

會建立 NEURON 模擬,使用 titration 找出每條神經的最小激發電流(threshold)

 

7.分析神經模擬

 

 

取出每條神經的 Titration Factor

 

8.分析與繪製Recruitment Curve

 

 

建立 log-spaced 電流序列 

計算每個電流下的被激發比例(%)

繪製出 Recruitment Curve

 

9.分析與繪製Selectivity Curve

 

 

會針對每個電流點模擬一次,取出每個 fascicle 的 Selectivity Index

 

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