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【后处理】Sim4Life 汇出的 .mat 档的数值精度是单精度,数据汇出器(Exporter)可以支援双精度导出吗?
Sim4Life 中大多数栏位资料物件是单精确度的,因此与汇出器(Exporter)本身无关。如果要使用资料的原始数据型态,资料快取汇出器(Data Cache Exporter)会保留栏位资料的类型
【后处理】使用 Slice Viewer 显示模拟数据时没有出现任何的结果,且在 Log 视窗出现错误与警告讯息
错误与警告讯息:
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Warning : The system has no used degrees of freedom (dofs). Therefore, nothing is assembled. This may be related to the simulation not containing any lossy dielectrics, e.g., a requirement for the magneto-quasi-static and stationary current model. Check your model and solid region settings.
说明:
Voxel 设定中的物件可能有遗失,检查其他设定(Materials, Sources, …)中物件的总数量是否有和 Voxel 设定中的物件数量一致。
【后处理】Sim4Life V6.2 版本中,神经模拟结果的数值单位显示错误
说明:
在 Sim4Life v6.2 版本中,神经动力学模拟的 i_membrane 输出单位应为安培,然而它实际的单位为 "安培/cm2",因此缺少因子 104。该错误已进行了故障排除并修复,在最新的 Sim4Life 桌机和网页版中显示了正确且相同的结果。而初始网页版 S4L-lite 是在上述错误检测和修复之前发布的,它会显示错误的结果。S4L-lite 后续版本也进行了错误修正。
此外,Sim4Life v7.0 中神经组织进行了重构,有存在着额外的 10-1 因子差异。因此,建议将模拟结果放大 104 (S4L-lite) 或 103 (v6.2),使其与最新 Sim4Life 桌机/网页版结果保持同步。
PS. 对于 NEURO 相关的应用程序,强烈建议旧版用户迁移到 v7.0 或更高版本,因为新版本对 T-NEURON 模组进行了重大重构、加速和改进。因此,v6.x 与 v7+ 必然会出现分歧。v7.0 使所有 NEURON 模组功能连贯且更加准确,因此,旧版用户必须进行版本升级以提高准确性、速度以及保持与网页版本和当前/未来 Sim4Life 桌机版本的兼容性。
【画面显示问题】Sim4Life 7.2 中 Controller 视窗的文字无法完全显示
画面显示
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解决方法
调整系统显示设定的缩放比例为 100%,如下图所示:
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[补充] 在 Windows Server 2016 中,一般使用者和远端会话中的使用者无法变更全域 DPI 设定。只有登入 Windows Server 或电脑主控台的系统管理员才能变更全域 DPI 设定,而且需要重新开机。修改本地显示器设定不会影响远程服务器画面。
【画面显示问题】Sim4Life 7.2.0.11026 版本的视窗画面中工具栏位消失、Sc
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请更改 Windows 的系统设定,即可解决此版本的画面显示问题。
解决方法
Windows 10 系统
1. 右键点击 Sim4Life 图标,选择 "性质(Properties)"
2. 到 "相容性(Compatibility)" 标签,点选 "改变高 DPI 设定(Change high DPI settings)"
3. 勾选 "覆写高 DPI 缩放行为(Override high DPI scaling behavior)"
4. 选择 "系统(System)"
5. 点选 OK,然后按 "套用(Apply)",再按 OK
6. 启动 Sim4Life
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Windows 8.1 系統
【画面显示问题】在 Sim4Life GUI 点击 View 标签后,没有出现 Workbench 的选项
View 选项画面
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Sim4Life 所有的视窗(例如: Workbench, Explorer, Properties)都可以从图形界面中显示/隐藏。若要使 Workbench 再次出现,可点击 Sim4Life 中的 VIEW -> Workbench。
但由于视窗可以调整大小和移动,在某些情况下,Workbench 视窗几乎不可见,可能与 Sim4Life 介面分离,甚至可能在另一台显示器上。如果视窗丢失了,可以将 GUI 外观重置为其默认配置。
解决方案 1: 删除相关的 Preference 文件
解决方案 2: 从 Registry 删除 Sim4Life 的 UI 设置(相当于对 GUI 设置进行硬重置)
【档案启动问题】启动 Sim4Life 时 Console 视窗出现 PdhCollectQueryData 错误讯息
错误讯息:
Error: PdhCollectQueryData failed
Error: PdhAddCounter for processor total failed
说明:
这是与 Windows 配置相关的问题,使用者无权存取日志计数器数据。请以管理员身分登入,将使用者新增至 Performance Logs User Group
设定流程:
(1) 按「开始」>「控制台」>「系统管理工具」>「电脑管理」
(2) 在「电脑管理(本机)」中,转到「系统工具」>「本地使用者和群组」>「群组」
(3) 按两下 Performance Monitor Users
(4) 按两下 ”新增(D)…”
(5) 在 ”输入物件名称来选取(E):” 输入用户名称,然后按下 ”确定”
(6) 按两下 ”套用”,然后按两下 ”确定”
参考连结: https://learn.microsoft.com/en-us/windows/win32/perfctrs/limited-user-access-support
【远端连线与ARES】ARES 无法读取 GPU 的讯息
1. 复制电脑系统中 nvidia-smi.exe 档案到 Sim4Life 文件夹路径 ...\sc
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2. 将 ...\sc
3. 将已错误修正的 ExtractCudaInfo.py 新档案放到 ...\sc
4. 在命令提示字元视窗( \sc
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5. 检查 ARES 视窗是否显示 GPU 资讯
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【远端连线与ARES】若计算服务器使用 Linux 系统并需要在 Window 桌机上的 Sim4Life 介面设定模拟参数和提交计算任务给服务器运算。如何进行相关的连线运算设定?
在 Linux 服务器上进行运算需要安装 singularity 版本的 iSolve 应用程式 (singularity 版本是 Linux 中最容易安装的版本)。目前 Windows 和 Linux 版本之间(如: ARES)没有直接通讯的功能。实际做法须透过 SFTP 将模拟档案传送到 Linux 或在 Windows 中安装 Linux 分割区。
相关设定可进一步参考以下 Sim4Life 教材的说明:
【远端连线与ARES】Console 视窗出现错误讯息: [Error] The application lost the connection to the license server and will shut down.
如果 license server 位于执行模拟的同一台电脑上,可能会发生这种连线遗失的情况。CPU 忙于模拟任务且没有空闲的 CPU 用于其他进程(例如: license server),例如: 大规模的 EM-QS 计算。因此,一种解决方案是在 EM-QS 模拟任务中使用较少的内核,以便仍有 CPU 用于其他进程,或是将 license server 移至另一台电脑。
【远端连线与ARES】运行 Sim4Life 时 ARES 突然断线
(1) 检查防火墙或防毒软件有没有临时阻止了 ARES 的运作,将 ARES 加入防火墙或防毒软件的白名单
(2) 有时候有些遗留的进程可能会阻止 ARES 正常运作,需要重新开机
【远端连线与ARES】Console 视窗显示错误讯息: [Error] Could not connect to Application@127.0.0.1:9090: connect() failed: errno = 10061: 无法连线,因为目标电脑拒绝连线
请检查电脑上的防火墙或防毒软件是否阻挡连线,或是更改连线的端口设置(预设: 18701),例如: 6665。
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